Die Schüler*innen der ESBZ nehmen am Ende des 13. Jahrgangs an den Berliner Abiturprüfungen teil. Obwohl die Schüler*innen der ESBZ erst ab der 9. Klasse Noten erhalten und auch in den höheren Jahrgängen das Erreichen eines individuellen Lernfortschritts im Vordergrund steht, sind die Abiturergebnisse seit dem ersten Abiturjahrgang 2014 immer überdurchschnittlich.